Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFT52Q9Y366 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFT52Q9Y366 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms