Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms