Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC12A4Q9UP95 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms