Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL4Q9UJQ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms