Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms