Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms