Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms