Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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