Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms