Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMTM6Q9NX76 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms