Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms