Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFB11Q9NX14 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms