Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED17Q9NVC6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms