Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms