Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT84Q9NSB2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms