Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms