Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms