Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPJQ9HC77 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms