Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEBOXQ9HB31 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms