Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms