Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR1EQ9GZS1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms