Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHACTR1Q9C0D0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms