Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms