Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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