Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms