Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms