Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD5Q99717 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms