Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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