Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TEFMQ96QE5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms