Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP3Q96P20 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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