Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms