Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL15Q96M94 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms