Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UBE2E2Q96LR5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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UBE2E2Q96LR5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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