Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PRAC1Q96KF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms