Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BORCS6Q96GS4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms