Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHFRQ96EP1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms