Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms