Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM3DQ96BQ1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM3DQ96BQ1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM3DQ96BQ1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM3DQ96BQ1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM3DQ96BQ1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM3DQ96BQ1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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