Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEIL2Q969S2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms