Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms