Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms