Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF128Q8TEB7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF128Q8TEB7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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