Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFXN5Q8TD22 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms