Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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