Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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