Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms