Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMER3Q8N944 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMER3Q8N944 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms