Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms