Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SVOPQ8N4V2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms