Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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